Application of various statistical methods to analyze genetic diversity of Austrian (Pinus nigra Arn.) and Scots pine (Pinus sylvestris L.) based on protein markers
Primena različitih statističkih metoda za analizu genetičkog diverziteta crnog (Pinus nigra Arn.) i belog bora (Pinus sylvestris L.) na osnovu proteinskih markera

2011
Authors
Lučić, AleksandarIsajev, Vasilije
Rakonjac, Ljubinko
Mataruga, Milan
Babić, Vojka

Ristić, Danijela

Mladenović Drinić, Snežana

Article (Published version)
Metadata
Show full item recordAbstract
This paper presents the results of studies on protein polymorphism in seeds of Scots pine (Pinus sylvestris L.) and Austrian pine (Pinus nigra Arn.) as the most important economic species of the genus Pinus in Serbia. Polymorphism of protein markers was determined in selected genotypes originating from seven populations (Scots pine) and six populations (Austrian pine). Analysis of protein markers was performed using two statistical methods, NTSYS and correspondence analysis. Both methods give the same arrangement of the analyzed populations, whereby, because of a different view of genetic distances, they can and should be combined, enabling easier and more precise understanding of mutual relationships of the observation units.
U radu su prikazani rezultati proučavanja polimorfizma proteina u semenu belog (Pinus sylvestris L.) i crnog bora (Pinus nigra Arn.) kao najvažnijih ekonomskih vrsta iz roda Pinus u Srbiji. Polimorfizam proteinskih markera utvrđen je u odabranim genotipovima poreklom iz sedam populacija (beli bor) i šest populacija (crni bor). Analiza proteinskih markera vršena je upotrebom dva statistička metoda, NTSYS i korespodencijalna analiza. Dobijeni rezultati upotrebom različitih statističkih metoda (NTSYS i korespodencionalna analiza) u analizi proteinskih markera, upućujući na upotrebu oba metoda u sličnim istraživanjima, kao kompatibilnih. Grafikoni obe metode se karakterišu istim rasporedom analiziranih populacija, pri čemu se usled različitog prikaza trebaju kombinovati, što omogućuje lakše i preciznije sagledavanje međusobnih odnosa jedinica posmatranja. Takođe, dobijeni rezultati u ovom radu ukazuju na: · Postojanje značajne genetičke varijabilnosti populacija belog i crnog bora. · Snaža...n uticaj geografske distance i izolovanosti populacija na genetičku izdiferenciranost. Ujedno, rezultati istraživanja pružaju osnovu za bliže upoznavanje veoma varijabilne i specifične unutarvrsne genetičke strukture belog i crnog bora u Srbiji, što predstavlja polazno sredstvo u planiranju procesa konzervacija i oplemenjivanja vrsta.
Keywords:
Austrian pine / correspondence analysis / NTSYS / proteins / Scots pineSource:
Genetika, 2011, 43, 3, 477-486Publisher:
- Društvo genetičara Srbije, Beograd
Funding / projects:
- Studying climate change and its influence on environment: impacts, adaptation and mitigation (RS-43007)
DOI: 10.2298/GENSR1103477L
ISSN: 0534-0012
WoS: 000299730100006
Scopus: 2-s2.0-84858377494
Collections
Institution/Community
MRIZPTY - JOUR AU - Lučić, Aleksandar AU - Isajev, Vasilije AU - Rakonjac, Ljubinko AU - Mataruga, Milan AU - Babić, Vojka AU - Ristić, Danijela AU - Mladenović Drinić, Snežana PY - 2011 UR - http://rik.mrizp.rs/handle/123456789/367 AB - This paper presents the results of studies on protein polymorphism in seeds of Scots pine (Pinus sylvestris L.) and Austrian pine (Pinus nigra Arn.) as the most important economic species of the genus Pinus in Serbia. Polymorphism of protein markers was determined in selected genotypes originating from seven populations (Scots pine) and six populations (Austrian pine). Analysis of protein markers was performed using two statistical methods, NTSYS and correspondence analysis. Both methods give the same arrangement of the analyzed populations, whereby, because of a different view of genetic distances, they can and should be combined, enabling easier and more precise understanding of mutual relationships of the observation units. AB - U radu su prikazani rezultati proučavanja polimorfizma proteina u semenu belog (Pinus sylvestris L.) i crnog bora (Pinus nigra Arn.) kao najvažnijih ekonomskih vrsta iz roda Pinus u Srbiji. Polimorfizam proteinskih markera utvrđen je u odabranim genotipovima poreklom iz sedam populacija (beli bor) i šest populacija (crni bor). Analiza proteinskih markera vršena je upotrebom dva statistička metoda, NTSYS i korespodencijalna analiza. Dobijeni rezultati upotrebom različitih statističkih metoda (NTSYS i korespodencionalna analiza) u analizi proteinskih markera, upućujući na upotrebu oba metoda u sličnim istraživanjima, kao kompatibilnih. Grafikoni obe metode se karakterišu istim rasporedom analiziranih populacija, pri čemu se usled različitog prikaza trebaju kombinovati, što omogućuje lakše i preciznije sagledavanje međusobnih odnosa jedinica posmatranja. Takođe, dobijeni rezultati u ovom radu ukazuju na: · Postojanje značajne genetičke varijabilnosti populacija belog i crnog bora. · Snažan uticaj geografske distance i izolovanosti populacija na genetičku izdiferenciranost. Ujedno, rezultati istraživanja pružaju osnovu za bliže upoznavanje veoma varijabilne i specifične unutarvrsne genetičke strukture belog i crnog bora u Srbiji, što predstavlja polazno sredstvo u planiranju procesa konzervacija i oplemenjivanja vrsta. PB - Društvo genetičara Srbije, Beograd T2 - Genetika T1 - Application of various statistical methods to analyze genetic diversity of Austrian (Pinus nigra Arn.) and Scots pine (Pinus sylvestris L.) based on protein markers T1 - Primena različitih statističkih metoda za analizu genetičkog diverziteta crnog (Pinus nigra Arn.) i belog bora (Pinus sylvestris L.) na osnovu proteinskih markera VL - 43 IS - 3 SP - 477 EP - 486 DO - 10.2298/GENSR1103477L UR - conv_456 ER -
@article{ author = "Lučić, Aleksandar and Isajev, Vasilije and Rakonjac, Ljubinko and Mataruga, Milan and Babić, Vojka and Ristić, Danijela and Mladenović Drinić, Snežana", year = "2011", abstract = "This paper presents the results of studies on protein polymorphism in seeds of Scots pine (Pinus sylvestris L.) and Austrian pine (Pinus nigra Arn.) as the most important economic species of the genus Pinus in Serbia. Polymorphism of protein markers was determined in selected genotypes originating from seven populations (Scots pine) and six populations (Austrian pine). Analysis of protein markers was performed using two statistical methods, NTSYS and correspondence analysis. Both methods give the same arrangement of the analyzed populations, whereby, because of a different view of genetic distances, they can and should be combined, enabling easier and more precise understanding of mutual relationships of the observation units., U radu su prikazani rezultati proučavanja polimorfizma proteina u semenu belog (Pinus sylvestris L.) i crnog bora (Pinus nigra Arn.) kao najvažnijih ekonomskih vrsta iz roda Pinus u Srbiji. Polimorfizam proteinskih markera utvrđen je u odabranim genotipovima poreklom iz sedam populacija (beli bor) i šest populacija (crni bor). Analiza proteinskih markera vršena je upotrebom dva statistička metoda, NTSYS i korespodencijalna analiza. Dobijeni rezultati upotrebom različitih statističkih metoda (NTSYS i korespodencionalna analiza) u analizi proteinskih markera, upućujući na upotrebu oba metoda u sličnim istraživanjima, kao kompatibilnih. Grafikoni obe metode se karakterišu istim rasporedom analiziranih populacija, pri čemu se usled različitog prikaza trebaju kombinovati, što omogućuje lakše i preciznije sagledavanje međusobnih odnosa jedinica posmatranja. Takođe, dobijeni rezultati u ovom radu ukazuju na: · Postojanje značajne genetičke varijabilnosti populacija belog i crnog bora. · Snažan uticaj geografske distance i izolovanosti populacija na genetičku izdiferenciranost. Ujedno, rezultati istraživanja pružaju osnovu za bliže upoznavanje veoma varijabilne i specifične unutarvrsne genetičke strukture belog i crnog bora u Srbiji, što predstavlja polazno sredstvo u planiranju procesa konzervacija i oplemenjivanja vrsta.", publisher = "Društvo genetičara Srbije, Beograd", journal = "Genetika", title = "Application of various statistical methods to analyze genetic diversity of Austrian (Pinus nigra Arn.) and Scots pine (Pinus sylvestris L.) based on protein markers, Primena različitih statističkih metoda za analizu genetičkog diverziteta crnog (Pinus nigra Arn.) i belog bora (Pinus sylvestris L.) na osnovu proteinskih markera", volume = "43", number = "3", pages = "477-486", doi = "10.2298/GENSR1103477L", url = "conv_456" }
Lučić, A., Isajev, V., Rakonjac, L., Mataruga, M., Babić, V., Ristić, D.,& Mladenović Drinić, S.. (2011). Application of various statistical methods to analyze genetic diversity of Austrian (Pinus nigra Arn.) and Scots pine (Pinus sylvestris L.) based on protein markers. in Genetika Društvo genetičara Srbije, Beograd., 43(3), 477-486. https://doi.org/10.2298/GENSR1103477L conv_456
Lučić A, Isajev V, Rakonjac L, Mataruga M, Babić V, Ristić D, Mladenović Drinić S. Application of various statistical methods to analyze genetic diversity of Austrian (Pinus nigra Arn.) and Scots pine (Pinus sylvestris L.) based on protein markers. in Genetika. 2011;43(3):477-486. doi:10.2298/GENSR1103477L conv_456 .
Lučić, Aleksandar, Isajev, Vasilije, Rakonjac, Ljubinko, Mataruga, Milan, Babić, Vojka, Ristić, Danijela, Mladenović Drinić, Snežana, "Application of various statistical methods to analyze genetic diversity of Austrian (Pinus nigra Arn.) and Scots pine (Pinus sylvestris L.) based on protein markers" in Genetika, 43, no. 3 (2011):477-486, https://doi.org/10.2298/GENSR1103477L ., conv_456 .