The application of molecular markers in the bulk segregant analysis of kernel oil content in two maize (Zea mays L.) synthetic populations

Abstract

RFLP loci, potential indicators of kernel high oil content, were identified using bulk segregant analysis (BSA) approach, i.e. bulked samples derived from C0 and C9 selection cycles of two maize synthetic populations - DS7u and YuSSSu. The kernel oil content was determined by the NMR spectroscopy. The genome analysis of bulked samples was carried out with 57 RFLP markers (UMC core set). On the basis of allele frequency differences between cycles of selection, informative RFLP markers (potentially closely linked to QTLs regulating high oil content in maize) were identified. Four common RFLP loci were identified in both DS7u and YuSSSu populations. Additional four RFLPs were identified in DS7u population.

RFLP lokusi, potencijalni indikatori povećanog sadržaja ulja u zrnu, identifikovani su analizom grupnih uzoraka (Bulk Segregant Analysis - BSA) C0 i C9 ciklusa selekcije dve domaće sintetičke populacije kukuruza - DS7u i YuSSSu. Sadržaj ulja u zrnu biljaka ispitivanih ciklusa selekcije obe populacije utvrđen je NMR spektroskopijom. Analiza genoma grupnih uzoraka početnog (C0) i krajnjeg (C9) ciklusa selekcije DS7u i YuSSSu urađena je pomoću 57 RFLP markera UMC core set. Na osnovu promena u frekvenciji alela u grupnim uzorcima u toku procesa selekcije analiziranih populacija utvrđene su informativne probe - probe potencijalno blisko vezane za QTL uključene u kontrolu povećanog sadržaja ulja u zrnu kukuruza. Identifikovana su četiri zajednička RFLP lokusa u obe analizirane populacije, s tim što je u populaciji DS7u identifikovano još četiri RFLP lokusa potencijalnih indikatora povećanog sadržaja ulja u zrnu kukuruza.