РИК - Репозиторијум института за кукуруз „Земун поље", Београд
Институт за кукуруз „Земун поље", Београд, Србија
    • English
    • Српски
    • Српски (Serbia)
  • Српски (ћирилица) 
    • Енглески
    • Српски (ћирилица)
    • Српски (латиница)
  • Пријава
Преглед записа 
  •   РИК
  • MRIZP
  • Радови истраживача / Researchers' publications
  • Преглед записа
  •   РИК
  • MRIZP
  • Радови истраживача / Researchers' publications
  • Преглед записа
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

SSR markers in characterization of sweet corn inbred lines

SSR markeri u karakterizaciji samooplodnih linija kukuruza šećerca

Thumbnail
2008
215.pdf (171.4Kb)
Аутори
Srdić, Jelena
Nikolić, Ana
Pajić, Zorica
Чланак у часопису (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документу
Апстракт
Sweet corn differs from field corn in many important traits. So its breeding although includes some standard procedures demand application of techniques that are important for determining special traits, all because of the specificity of its usage. Application of molecular markers becomes almost a necessity for the breeding of sweet corn, especially because this is the type of maize in which still no definitive heterotic patterns have been determined. So getting to know genetic divergence of the sweet corn inbred lines is of great importance for its breeding. In this paper we analyzed genetic similarity of six sweet corn inbreds based on SSR markers. 40 SSR primers were used in DNA amplification. Results were compared and correlated with the data on specific combining ability, obtained by the diallel analysis. The results of SCA were in concurrence with genetic similarity. Values of rank correlation coefficient were negative, indicating that more similar inbred lines had smaller estima...tes of SCA, and lines that were less similar had higher estimates of SCA. Rank correlation coefficient between SCA and GS according to Dice coefficient was between -0,16 and -0,57*.

Kukuruz šećerac razlikuje se od kukuruza standardnog kvaliteta zrna u većem broju značajnih osobina. Zbog toga oplemenjivanje ove kulture pored standardnih procedura obuhvata i neke posebne, a sve zbog specifičnosti njegovog korišćenja. Primena molekularnih markera u oplemenjivanju šećerca postaje neophodnost, naročito zbog toga što kod ovog tipa kukuruza još uvek nisu utvrđene heterotične grupe, pa je upoznavanje genetičke varijabilnosti samooplodnih linija šećerca na molekularnom nivou od velikog značaja za njegovo oplemenjivanje. U radu analizirana je genetička sličnost 6 samooplodnih linija kukuruza šećerca na osnovu SSR markera. Primenjen je set od 40 prajmera. Dobijeni rezultati upoređeni sa podacima specifičnih kombinacionih sposobnosti prinosa klipa, dobijenih dialelnom analizom. Koeficijent korelacije ranga između GS i PKS bio je negativan i u jednom slučaju statistički značajan, a kretao se od -0,16 and -0,57*. Negativna vrednost ovog koeficijenta ukazuje na to da se sa poveć...anjem sličnosti genotipova smanjuje vrednost PKS i obrnuto. Statistička značajnost ovog koeficijenta ukazuje na pozdanost primene SSR markera u proceni genetičke sličnosti i planiranju perspektivnih ukrštanja.

Кључне речи:
genetic similarity / SSR / sweet corn / SCA
Извор:
Genetika, 2008, 40, 2, 169-177
Издавач:
  • Društvo genetičara Srbije, Beograd

DOI: 10.2298/GENSR0802169S

ISSN: 0534-0012

[ Google Scholar ]
URI
http://rik.mrizp.rs/handle/123456789/217
Колекције
  • Радови истраживача / Researchers' publications
Институција/група
MRIZP
TY  - JOUR
AU  - Srdić, Jelena
AU  - Nikolić, Ana
AU  - Pajić, Zorica
PY  - 2008
UR  - http://rik.mrizp.rs/handle/123456789/217
AB  - Sweet corn differs from field corn in many important traits. So its breeding although includes some standard procedures demand application of techniques that are important for determining special traits, all because of the specificity of its usage. Application of molecular markers becomes almost a necessity for the breeding of sweet corn, especially because this is the type of maize in which still no definitive heterotic patterns have been determined. So getting to know genetic divergence of the sweet corn inbred lines is of great importance for its breeding. In this paper we analyzed genetic similarity of six sweet corn inbreds based on SSR markers. 40 SSR primers were used in DNA amplification. Results were compared and correlated with the data on specific combining ability, obtained by the diallel analysis. The results of SCA were in concurrence with genetic similarity. Values of rank correlation coefficient were negative, indicating that more similar inbred lines had smaller estimates of SCA, and lines that were less similar had higher estimates of SCA. Rank correlation coefficient between SCA and GS according to Dice coefficient was between -0,16 and -0,57*.
AB  - Kukuruz šećerac razlikuje se od kukuruza standardnog kvaliteta zrna u većem broju značajnih osobina. Zbog toga oplemenjivanje ove kulture pored standardnih procedura obuhvata i neke posebne, a sve zbog specifičnosti njegovog korišćenja. Primena molekularnih markera u oplemenjivanju šećerca postaje neophodnost, naročito zbog toga što kod ovog tipa kukuruza još uvek nisu utvrđene heterotične grupe, pa je upoznavanje genetičke varijabilnosti samooplodnih linija šećerca na molekularnom nivou od velikog značaja za njegovo oplemenjivanje. U radu analizirana je genetička sličnost 6 samooplodnih linija kukuruza šećerca na osnovu SSR markera. Primenjen je set od 40 prajmera. Dobijeni rezultati upoređeni sa podacima specifičnih kombinacionih sposobnosti prinosa klipa, dobijenih dialelnom analizom. Koeficijent korelacije ranga između GS i PKS bio je negativan i u jednom slučaju statistički značajan, a kretao se od -0,16 and -0,57*. Negativna vrednost ovog koeficijenta ukazuje na to da se sa povećanjem sličnosti genotipova smanjuje vrednost PKS i obrnuto. Statistička značajnost ovog koeficijenta ukazuje na pozdanost primene SSR markera u proceni genetičke sličnosti i planiranju perspektivnih ukrštanja.
PB  - Društvo genetičara Srbije, Beograd
T2  - Genetika
T1  - SSR markers in characterization of sweet corn inbred lines
T1  - SSR markeri u karakterizaciji samooplodnih linija kukuruza šećerca
VL  - 40
IS  - 2
SP  - 169
EP  - 177
DO  - 10.2298/GENSR0802169S
UR  - conv_416
ER  - 
@article{
author = "Srdić, Jelena and Nikolić, Ana and Pajić, Zorica",
year = "2008",
abstract = "Sweet corn differs from field corn in many important traits. So its breeding although includes some standard procedures demand application of techniques that are important for determining special traits, all because of the specificity of its usage. Application of molecular markers becomes almost a necessity for the breeding of sweet corn, especially because this is the type of maize in which still no definitive heterotic patterns have been determined. So getting to know genetic divergence of the sweet corn inbred lines is of great importance for its breeding. In this paper we analyzed genetic similarity of six sweet corn inbreds based on SSR markers. 40 SSR primers were used in DNA amplification. Results were compared and correlated with the data on specific combining ability, obtained by the diallel analysis. The results of SCA were in concurrence with genetic similarity. Values of rank correlation coefficient were negative, indicating that more similar inbred lines had smaller estimates of SCA, and lines that were less similar had higher estimates of SCA. Rank correlation coefficient between SCA and GS according to Dice coefficient was between -0,16 and -0,57*., Kukuruz šećerac razlikuje se od kukuruza standardnog kvaliteta zrna u većem broju značajnih osobina. Zbog toga oplemenjivanje ove kulture pored standardnih procedura obuhvata i neke posebne, a sve zbog specifičnosti njegovog korišćenja. Primena molekularnih markera u oplemenjivanju šećerca postaje neophodnost, naročito zbog toga što kod ovog tipa kukuruza još uvek nisu utvrđene heterotične grupe, pa je upoznavanje genetičke varijabilnosti samooplodnih linija šećerca na molekularnom nivou od velikog značaja za njegovo oplemenjivanje. U radu analizirana je genetička sličnost 6 samooplodnih linija kukuruza šećerca na osnovu SSR markera. Primenjen je set od 40 prajmera. Dobijeni rezultati upoređeni sa podacima specifičnih kombinacionih sposobnosti prinosa klipa, dobijenih dialelnom analizom. Koeficijent korelacije ranga između GS i PKS bio je negativan i u jednom slučaju statistički značajan, a kretao se od -0,16 and -0,57*. Negativna vrednost ovog koeficijenta ukazuje na to da se sa povećanjem sličnosti genotipova smanjuje vrednost PKS i obrnuto. Statistička značajnost ovog koeficijenta ukazuje na pozdanost primene SSR markera u proceni genetičke sličnosti i planiranju perspektivnih ukrštanja.",
publisher = "Društvo genetičara Srbije, Beograd",
journal = "Genetika",
title = "SSR markers in characterization of sweet corn inbred lines, SSR markeri u karakterizaciji samooplodnih linija kukuruza šećerca",
volume = "40",
number = "2",
pages = "169-177",
doi = "10.2298/GENSR0802169S",
url = "conv_416"
}
Srdić, J., Nikolić, A.,& Pajić, Z.. (2008). SSR markers in characterization of sweet corn inbred lines. in Genetika
Društvo genetičara Srbije, Beograd., 40(2), 169-177.
https://doi.org/10.2298/GENSR0802169S
conv_416
Srdić J, Nikolić A, Pajić Z. SSR markers in characterization of sweet corn inbred lines. in Genetika. 2008;40(2):169-177.
doi:10.2298/GENSR0802169S
conv_416 .
Srdić, Jelena, Nikolić, Ana, Pajić, Zorica, "SSR markers in characterization of sweet corn inbred lines" in Genetika, 40, no. 2 (2008):169-177,
https://doi.org/10.2298/GENSR0802169S .,
conv_416 .

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
О Репозиторијуму Института за кукуруз „Земун поље“ (РИК) | Пошаљите запажања

OpenAIRERCUB
 

 

Комплетан репозиторијумИнституцијеАуториНасловиТемеОва институцијаАуториНасловиТеме

Статистика

Преглед статистика

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
О Репозиторијуму Института за кукуруз „Земун поље“ (РИК) | Пошаљите запажања

OpenAIRERCUB