RIK - Repozitorijum instituta za kukuruz „Zemun polje", Beograd
Institut za kukuruz „Zemun polje", Beograd, Srbija
    • English
    • Српски
    • Српски (Serbia)
  • Srpski (latinica) 
    • Engleski
    • Srpski (ćirilica)
    • Srpski (latinica)
  • Prijava
Pregled zapisa 
  •   RIK
  • MRIZP
  • Радови истраживача / Researchers' publications
  • Pregled zapisa
  •   RIK
  • MRIZP
  • Радови истраживача / Researchers' publications
  • Pregled zapisa
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

QTL detection for drought tolerance in composite maize populations

Detekcija QTL-ova za tolerantnost na sušu kompozitnih populacija kukuruza (Zea mays L.)

Thumbnail
2006
114.pdf (294.8Kb)
Autori
Ignjatović-Micić, Dragana
Marković, Ksenija
Lazić-Jančić, Vesna
Članak u časopisu (Objavljena verzija)
Metapodaci
Prikaz svih podataka o dokumentu
Apstrakt
The most significant QTLs for leaf ABA and root characteristics are shown to be on chromosomes 1 (bin 1.06) and 2 (bin 2.04). Assuming that the same QTLs could be present in different genotypes, the objective of this work was to ascertain if the QTLs with major effect detected i n one genotype could be detected in a different genetic background with different molecular markers of that chromosome region. Also, bulk segregant analysis (BSA) of 10 tolerant and 10 susceptible to drought maize populations was performed in order to confirm the potential of this approach in informative marker identification. Probes umc1601, umc1776, bnlg2248, dupSSR27 and bnlg2246 detected allele frequency differences between tolerant and susceptible populations of over 14%. It was also shown that BSA can identify informative molecular markers, although marker analysis of individual plants is necessary for final conclusion about linkage of the marker and the trait of interest.
Najznačajniji QTL-ovi za sadržaj ABA u listu i neke karakteristike korenovog sistema se, prema podacima iz literature, nalaze na hromozomima 1 (bin 1.06) i 2 (bin 2.04). Pretpostavljajući da isti QTL-ovi mogu biti prisutni u različitim genotipovima, cilj ovog rada je bio da se utvrdi da li QTL-vi sa major efektom u jednom genotipu mogu biti detektovani u različitim genetičkim okruženjima, koristeći molekularne markers datog hromozomskog regiona. Takođe, analiza grupnih uzoraka 10 tolerantnih i 10 osetljivih populacija na sušu je urađena da bi se proverila ispravnost ovog pristupa u identifikaciji informativnih markera. Probama umc1601, umc1776, bnlg2248, dupSSR27 i bnlg2246 detektovana je razlika u frekvenciji alela između tolerantnih i osetljivih populacija veća od 14%, što ukazuje na moguću povezanost markera i svojstva od interesa, mada je za konačan zaključak neophodno uraditi analizu pojedinačnih biljaka grupnih uzoraka.
Ključne reči:
drought / bulk segregant analysis / SSR molecular markers / suša / analiza grupnih uzoraka / SSR markeri
Izvor:
Selekcija i semenarstvo, 2006, 12, 3-4, 49-53
Izdavač:
  • Društvo selekcionara i semenara Republike Srbije, Beograd

ISSN: 0354-5881

[ Google Scholar ]
URI
http://rik.mrizp.rs/handle/123456789/116
Kolekcije
  • Радови истраживача / Researchers' publications
Institucija/grupa
MRIZP
TY  - JOUR
AU  - Ignjatović-Micić, Dragana
AU  - Marković, Ksenija
AU  - Lazić-Jančić, Vesna
PY  - 2006
UR  - http://rik.mrizp.rs/handle/123456789/116
AB  - The most significant QTLs for leaf ABA and root characteristics are shown to be on chromosomes 1 (bin 1.06) and 2 (bin 2.04). Assuming that the same QTLs could be present in different genotypes, the objective of this work was to ascertain if the QTLs with major effect detected i n one genotype could be detected in a different genetic background with different molecular markers of that chromosome region. Also, bulk segregant analysis (BSA) of 10 tolerant and 10 susceptible to drought maize populations was performed in order to confirm the potential of this approach in informative marker identification. Probes umc1601, umc1776, bnlg2248, dupSSR27 and bnlg2246 detected allele frequency differences between tolerant and susceptible populations of over 14%. It was also shown that BSA can identify informative molecular markers, although marker analysis of individual plants is necessary for final conclusion about linkage of the marker and the trait of interest.
AB  - Najznačajniji QTL-ovi za sadržaj ABA u listu i neke karakteristike korenovog sistema se, prema podacima iz literature, nalaze na hromozomima 1 (bin 1.06) i 2 (bin 2.04). Pretpostavljajući da isti QTL-ovi mogu biti prisutni u različitim genotipovima, cilj ovog rada je bio da se utvrdi da li QTL-vi sa major efektom u jednom genotipu mogu biti detektovani u različitim genetičkim okruženjima, koristeći molekularne markers datog hromozomskog regiona. Takođe, analiza grupnih uzoraka 10 tolerantnih i 10 osetljivih populacija na sušu je urađena da bi se proverila ispravnost ovog pristupa u identifikaciji informativnih markera. Probama umc1601, umc1776, bnlg2248, dupSSR27 i bnlg2246 detektovana je razlika u frekvenciji alela između tolerantnih i osetljivih populacija veća od 14%, što ukazuje na moguću povezanost markera i svojstva od interesa, mada je za konačan zaključak neophodno uraditi analizu pojedinačnih biljaka grupnih uzoraka.
PB  - Društvo selekcionara i semenara Republike Srbije, Beograd
T2  - Selekcija i semenarstvo
T1  - QTL detection for drought tolerance in composite maize populations
T1  - Detekcija QTL-ova za tolerantnost na sušu kompozitnih populacija kukuruza (Zea mays L.)
VL  - 12
IS  - 3-4
SP  - 49
EP  - 53
UR  - conv_264
ER  - 
@article{
author = "Ignjatović-Micić, Dragana and Marković, Ksenija and Lazić-Jančić, Vesna",
year = "2006",
abstract = "The most significant QTLs for leaf ABA and root characteristics are shown to be on chromosomes 1 (bin 1.06) and 2 (bin 2.04). Assuming that the same QTLs could be present in different genotypes, the objective of this work was to ascertain if the QTLs with major effect detected i n one genotype could be detected in a different genetic background with different molecular markers of that chromosome region. Also, bulk segregant analysis (BSA) of 10 tolerant and 10 susceptible to drought maize populations was performed in order to confirm the potential of this approach in informative marker identification. Probes umc1601, umc1776, bnlg2248, dupSSR27 and bnlg2246 detected allele frequency differences between tolerant and susceptible populations of over 14%. It was also shown that BSA can identify informative molecular markers, although marker analysis of individual plants is necessary for final conclusion about linkage of the marker and the trait of interest., Najznačajniji QTL-ovi za sadržaj ABA u listu i neke karakteristike korenovog sistema se, prema podacima iz literature, nalaze na hromozomima 1 (bin 1.06) i 2 (bin 2.04). Pretpostavljajući da isti QTL-ovi mogu biti prisutni u različitim genotipovima, cilj ovog rada je bio da se utvrdi da li QTL-vi sa major efektom u jednom genotipu mogu biti detektovani u različitim genetičkim okruženjima, koristeći molekularne markers datog hromozomskog regiona. Takođe, analiza grupnih uzoraka 10 tolerantnih i 10 osetljivih populacija na sušu je urađena da bi se proverila ispravnost ovog pristupa u identifikaciji informativnih markera. Probama umc1601, umc1776, bnlg2248, dupSSR27 i bnlg2246 detektovana je razlika u frekvenciji alela između tolerantnih i osetljivih populacija veća od 14%, što ukazuje na moguću povezanost markera i svojstva od interesa, mada je za konačan zaključak neophodno uraditi analizu pojedinačnih biljaka grupnih uzoraka.",
publisher = "Društvo selekcionara i semenara Republike Srbije, Beograd",
journal = "Selekcija i semenarstvo",
title = "QTL detection for drought tolerance in composite maize populations, Detekcija QTL-ova za tolerantnost na sušu kompozitnih populacija kukuruza (Zea mays L.)",
volume = "12",
number = "3-4",
pages = "49-53",
url = "conv_264"
}
Ignjatović-Micić, D., Marković, K.,& Lazić-Jančić, V.. (2006). QTL detection for drought tolerance in composite maize populations. in Selekcija i semenarstvo
Društvo selekcionara i semenara Republike Srbije, Beograd., 12(3-4), 49-53.
conv_264
Ignjatović-Micić D, Marković K, Lazić-Jančić V. QTL detection for drought tolerance in composite maize populations. in Selekcija i semenarstvo. 2006;12(3-4):49-53.
conv_264 .
Ignjatović-Micić, Dragana, Marković, Ksenija, Lazić-Jančić, Vesna, "QTL detection for drought tolerance in composite maize populations" in Selekcija i semenarstvo, 12, no. 3-4 (2006):49-53,
conv_264 .

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
O Repozitorijumu Instituta za kukuruz „Zemun polje“ (RIK) | Pošaljite zapažanja

OpenAIRERCUB
 

 

Kompletan repozitorijumInstitucije/grupeAutoriNasloviTemeOva institucijaAutoriNasloviTeme

Statistika

Pregled statistika

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
O Repozitorijumu Instituta za kukuruz „Zemun polje“ (RIK) | Pošaljite zapažanja

OpenAIRERCUB